法律分析：
驾驶证违章被扣分了罚款也交完了，查询还显示违法未处理的原因可能有：
1、查询系统存在延迟，缴纳罚款的信息不能及时同同步，可以过段时间再查询；
2、用户可能网络不稳定，新的消息没有及时刷新，建议网络好的时候刷新系统；
3、工作人员对于处理结果还没有录入，因此还没有更新；
4、可以拨打电话询问原因，或者直接到交警大队查询相关内容。
法律依据：
《中华人民共和国行政处罚法》 第四十六条 作出罚款决定的行政机关应当与收缴罚款的机构分离。 除依照本法第四十七条、第四十八条的规定当场收缴的罚款外，作出行政处罚决定的行政机关及其执法人员不得自行收缴罚款。 当事人应当自收到行政处罚决定书之日起十五日内，到指定的银行缴纳罚款。银行应当收受罚款，并将罚款直接上缴国库。