两人开宾馆遇公安查房，应积极配合检查，保护客人隐私，了解自身权益，并合法维权。
当两人共同经营一家宾馆时，如果遇到公安部门进行房间检查，您可以采取以下措施：
1、合法经营：确保您的宾馆在合法经营的基础上，具备相关的许可证和证件。遵守当地的法律法规，确保宾馆的运营符合规定。
2、配合检查：当公安部门进行房间检查时，您应积极配合他们的工作。开门并提供所需的文件和信息，如宾客登记、身份证明等。与公安部门保持良好的沟通，尽量配合他们的要求。
3、保护客人隐私：在配合检查的同时，要确保客人的隐私得到保护。不得随意泄露客人的个人信息，如身份证号码、住宿记录等。尽量在公安部门的监督下，保护客人的合法权益。
4、了解权益：作为宾馆经营者，您应了解自己的权益和义务。在遇到公安部门检查时，如果您认为他们的行为有违法或不当之处，可以保留相关证据，并咨询律师以保护自己的权益。
5、合法维权：如果您认为公安部门的检查行为违法或侵犯了您的权益，您可以寻求法律援助或咨询律师，了解自己的维权途径和方法。
应对公安查房的有效策略主要包括以下几点：首先，确保宾馆的经营合法合规，确保所有证照齐全，如经营许可证、消防安全证等。其次，加强员工培训，使员工了解并遵守相关法规和规定，如身份登记、客人隐私保护等。同时，建立完善的监控系统，保证公安部门能够随时查阅相关监控录像。此外，及时与当地公安部门建立良好的沟通合作关系，定期向他们报备宾馆的经营情况，以增加互信和合作。另外，加强宾馆的安全管理，确保客人的人身和财产安全，避免涉及违法活动。最后，如遇到公安查房，应保持冷静，配合公安部门的工作，提供必要的协助和配合，以便尽快解决问题。通过以上策略的综合运用，可以更好地应对公安查房，确保宾馆的正常经营。
综上所述，当两人开宾馆遇到公安部门的房间检查时，合法经营、积极配合、保护客人隐私以及了解自己的权益都是重要的应对策略。如有需要，建议咨询专业律师以获取更具体和个性化的法律建议。
【法律依据】：
《旅馆业治安管理办法》
第六条
旅馆接待旅客住宿必须登记。登记时，应当查验旅客的身份证件，按规定的项目如实登记。
接待境外旅客住宿，还应当在24小时内向当地公安机关报送住宿登记表。