公积金贷款从来没有收取过“保证金”，所说的“保证金”通常为大众俗称的担保费，目前该费用已经取消，之前收取的，按原政策执行，因该笔费用是按贷款年限缴纳，提前还款的，按剩余的贷款期限申请退还。
1、公积金贷款的担保费是根据贷款金额和年限综合计算的。
2、2014年10月13日前，只要涉及到公积金贷款的，不管是二手房还是一手房都要按规定缴纳公积金的保证金。
3、2014年10月13日，多家媒体批露内部文件，住建部、财政部、央行等三部门联合发文，取消住房公积金个人住房贷款保险、公证、新房评估和强制性机构担保等收费项目，减轻贷款职工负担。另外，连续缴费6个月的职工就可以申请公积金贷款。
一、公积金计算基数是税前还是税后
根据我国法律规定，住房公积金的计算基数是按税前工资进行计算的。职工和单位住房公积金的缴存比例均不得低于5％，不得高于12％。
二、住房公积金缴存范围多大
下列单位及其在职职工
1、机关、事业单位；
2、国有企业，城镇集体企业，外商投资企业，港澳台商投资企业，城镇私营企业及其他城镇企业或经济组织；
3、民办非企业单位、社会团体；
4、外国及港澳台商投资企业和其他经济组织常驻代表机构。
城镇个体工商户、自由职业人员，可以申请缴存住房公积金（注：并不是每个社区城市的住房公积金管理中心都允许城镇个体工商户、自由职业人员交纳住房公积金，具体情况请咨询当地住房公积金管理机构）
职工和单位住房公积金的缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5％；有条件的城市，可以适当提高缴存比例。具体缴存比例由住房公积金管理委员会拟订，经本级人民政府审核后，报省、自治区、直辖市人民政府批准。城镇个体工商户、自由职业人员住房公积金的月缴存基数原则上按照缴存人上一年度月平均纳税收入计算。
单位不办理住房公积金缴存登记或者不为本单位职工办理住房公积金账户设立手续的，由住房公积金管理中心责令限期办理；逾期不办理的，处1万元以上5万元以下的罚款。
单位逾期不缴或者少缴住房公积金的，由住房公积金管理中心责令限期缴存；逾期仍不缴存的，可以申请人民法院强制执行。