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圆二色谱法测蛋白二级结构

来源:锐游网


圆二色谱是一种特殊的吸收谱,它通过测量蛋白质等生物大分子的圆二色光谱,从而得到生物大分子的二级结构,简单、快捷,广泛应用在蛋白质折叠,蛋白质构象研究,酶动力学等领域。 圆二色谱紫外区段(190-240nm),主要生色团是肽链,这一波长范围的CD谱包含了生物大分子主链构象的信息。α-螺旋构象的CD谱在222nm、208nm处呈负峰,在190nm附近有一正峰。β-折叠构象的CD谱,在217-218nm处有一负峰,在195-198nm处有一强的正峰。无规则卷曲构象的CD谱在198nm附近有一负峰,在220nm附近有一小而宽的正峰。

蛋白浓度与使用的光径厚度和测量区域有一定关系,对于测量远紫外区德氨基酸残基微环境的蛋白而言,浓度范围在~ml,则光径可选择在~之间,溶液体积则在200~500ul。而测量近紫外区的蛋白质三级结构,所需浓度要至少比远紫外区的浓10倍方能检测到有效信号,且一般光径的选择均在~,相应的体积也需增加至1~2mL

缓冲液可选50~100mmol trs-HCl、PBS等,尽量除去EDTA。

远紫外

近紫外

二硫键一般都是不对称的,它在圆二色性光谱上,于195-200nm和250-260处有谱峰

色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸残基的侧链其谱峰在230-310nm之间,色氨酸残基侧链的谱峰一般集中在290- 310nm之间,但有时也会向短波长方向移动从而与酪氨酸残基侧链的谱峰重叠

在250-260nm之间,苯环的谱峰又与二流键的谱峰重叠

溶液度吸收的影响

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