分为以下两种情况：
1、经济适用房分两种，经济适用房管理的房子，一般就是集资建房或者是回迁房，也就是常说的二类经济适用房，交易的时候买方出3%的土地出让金。
2、另外一种就是经济适用房立项的房子，回迁后不是按照回迁房给的，而是按照商品房处理的，所以商品房是不用交这个3%的。
法律依据：《土地管理法》第五十五条，以出让等有偿使用方式取得国有土地使用权的建设单位，按照规定的标准和办法，缴纳土地使用权出让金等土地有偿使用费和其他费用后，方可使用土地。自本法施行之日起，新增建设用地的土地有偿使用费，百分之三十上缴财政，百分之七十留给有关地方。具体使用管理办法由财政部门会同有关部门制定，并报批准。
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