是的，耕地占用税由地方税务机关负责征收。土地管理部门凭耕地占用税完税凭证或者免税凭证和其他有关文件发放建设用地批准书。
依据：《耕地占用税暂行条例》
第十二条 耕地占用税由地方税务机关负责征收。
土地管理部门在通知单位或者个人办理占用耕地手续时，应当同时通知耕地所在地同级地方税务机关。获准占用耕地的单位或者个人应当在收到土地管理部门的通知之日起30日内缴纳耕地占用税。土地管理部门凭耕地占用税完税凭证或者免税凭证和其他有关文件发放建设用地批准书。
第十六条 本条例自2008年1月1日起施行。1987年4月1日国务院发布的《中华人民共和国耕地占用税暂行条例》同时废止。
耕地占用税税额标准
各地方有所不同，2019年9月1日起与《中华人民共和国耕地占用税法》同步施行。按照《决定》，耕地占用税将施行新的适用税额标准，其中：占用耕地适用税额分为50、45、35、25元/平方米四档，占用非耕地适用税额，则按照占用耕地适用税额标准的60%执行。
新税额标准施行后，耕地占用税适用税额的平均水平由原来的38.55元/平方米降为30.92元/平方米（《耕地占用税法》规定我省耕地占用税税额平均水平不得低于30元/平方米）。
耕地占用税法实施办法
中华人民共和国耕地占用税法实施办法是为了实施《中华人民共和国耕地占用税法》而制定本办法。
根据《中华人民共和国耕地占用税法》第二条规定:经批准占用耕地的，纳税人为农用地转用审批文件中标明的建设用地人；农用地转用审批文件中未标明建设用地人的，纳税人为用地申请人，其中用地申请人为各级人民政府的，由同级土地储备中心、自然资源主管部门或政府委托的其他部门、单位履行耕地占用税申报纳税义务。
未经批准占用耕地的，纳税人为实际用地人。
根据《中华人民共和国耕地占用税法》第三条规定:实际占用的耕地面积，包括经批准占用的耕地面积和未经批准占用的耕地面积。
根据《中华人民共和国耕地占用税法》第四条规定:基本农田，是指依据《基本农田保护条例》划定的基本农田保护区范围内的耕地。
法律依据： 该内容由 毕日东律师 和 律说律答 共创回答
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