长江大学开题报告
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毕业设计开题报告
题 目 名 称: 学 院(系): 专 业 班 级: 学 生 姓 名: 指 导 教 师: 辅 导 教 师: 开题报告日期:
甘蓝型油菜品种资源群体结构的分析 生命科学院 生物技术31002班
袁梦思 孙文秀
2013年11月11日
1 题目来源 中国农业科学院油料作物研究所 2 研究目的和意义 分析1083份油菜的组分,分析1083份油菜品系的群体结构和群体遗传距离,评估甘蓝型油菜的LD模式。 群体结构和连锁不平衡分析是进行复杂性状关联分析的前提条件。在本研究中,利用167个单位点微卫星标记分析了来自全国各地相关领域研究院所提供的1083份甘蓝型油菜的遗传多样性,群体结构和LD水平。本研究对油菜群体结构和LD模式的分析为后续复杂性状关联分析奠定了基础。
3 阅读的主要参考文献及资料名称 [1] 马琳,刘海珍,陆徐忠,等.130份甘蓝型油菜种质分子身份证的构建[J]中国油料作物学报.2013,35(3):231-239 [2] 陈勋,吴江生,刘克德.春性与半冬性甘蓝型油菜的SSR标记多样性分析比较[J] 2010,32(1):006 -013 [3] 萨如拉.分子标记技术在油菜育种中的应用探讨[J]西藏农业科技.2009,31VolNo.2:38—40 [4] 许鲲,谷铁城,刘凤兰.甘蓝型油菜2009—2010年候选品种遗传多样性及群体结构[J]中国油料作物学报.2012,34(2):142-151 [5] 周峰.甘蓝型油菜的杂种优势及其与遗传距离的相关性分析[M]华中科技大学硕士学位论文 [6] 肖英杰,蔡东芳,杨巍,等.甘蓝型油菜关联群体的遗传结构和连锁不平衡模式[D]中国科技论文在线http://www.paper.edu.cn [7] 李海渤,杨军,吕泽文,等.甘蓝型油菜黄籽品种SSR指纹图谱的构建[J]中国油料作物学报.2010,32(3):329-336 [8] 黄莉.甘蓝型油菜杂种优势和遗传多样性的研究[M]华中农业大学硕士学位论文 [9] 陈斐,魏臻武,李伟民,等.基于SSR标记的苜蓿种质资源遗传多样性与群体结构分析[J]草地学报.July2013,Vol21 No.4:759—769 [10] 邹珺.新型甘蓝型油菜的遗传改良及其基因组结构分析[M]华中农业大学博士学位论文 [11] 危文亮,张艳欣,吕海霞,等.芝麻资源群体结构及含油量关联分析[J]中国农业科学.2012,45(10):1895-1903
4 国内外现状和发展趋势与研究的主攻方向 20世纪50年代以前,我国油菜栽培以白菜型和芥菜型品种为主,这些品种具有早熟、耐寒等特点,但籽粒小、抗病性差、产量低。新中国成立后,我国确定了以发展甘蓝型油菜为主的生产方向,通过对甘蓝型油菜进行选育,逐步更换了生产上产量较低 的白菜型和芥菜型农家油菜品种。甘蓝型油菜品种的推广和栽培技术水平的不断提高,使我国油菜生产在面积、产量和效益上均提高到了一个新的历史水平。目前,“ 杂优+双低”甘蓝型油菜的选育是我国油菜育种和推广的主要方向。 遗传多样性研究有益于正确制定油菜遗传资源的收集和原位保存的策略,是改良油菜品种的基础。从分子水平上揭示品种之间的遗传变异成为一项倍受全球重视且具有重要现实意义的工作。20世纪80年代发展起来的DNA分子标记是以DNA或mRNA的多态性 为基础的遗传标记,在油菜育种、品质鉴定以及遗传图谱的绘制、辅助选择育种等方面均得到了广泛应用和深入研究,为开发 油菜新品种、提高油菜产量、改善油菜品质、增强油菜抗性提供了空前的发展机遇 。 ①进一步完善分子标记在油菜遗传多样性分析中的应用技术降低使用成本,使分子标记与实践相结合,在全国各油菜育种单位广泛应用。②加强新型分子标记技术在甘蓝型油菜遗传多样性研究中的应用。靶位区域扩增多态性(TRAP)是一种新型的基于PCR的分子标记,2003年由美国农业部北方作物实验室Hu等提出。TRAP标记发展至今已被广泛应用于作物遗传多样性分析、基因定位、遗传图谱构建等,但该技术在我国油菜育种中的利用尚未见报道,因此,应加强对该技术进行研究应用。③充分结合利用已有的分子标记技术,使各处技术优缺点互补,全面、有效地分析我国甘蓝型油菜资源的多样性 。
5 主要研究内容、需重点研究的关键问题及解决思路 本课题选择武汉油料所阳逻试验田基地自然资源群体中双11和73290两种亲本通过几代杂交的群体为材料,于生育期蕾薹期取得甘蓝型油菜样品576份,然后用2×CTAB法提取DNA,将提取的DNA用经选取的一系列SSR引物进行PCR扩增,再对扩增的产物以聚丙烯凝胶电泳得出DNA带型结果,最后显影,读带并做记录。再对带型结果做软件分析,得出油菜种质资源遗传多样性的各类性状结果。 主要研究内容:利用STUCTURE软件对油菜的数据进行分析,计算群体间遗传距离,用QTL作出LD分布图,最后确定它们的LD衰减距离。
6 完成毕业设计(论文)所必须具备的工作条件(如工具书、计算机辅助设计、某类市场调研、实验设备和实验环境条件等)及解决的办法 参考期刊 长江大学图书馆自然科学期刊阅览室查阅 电子期刊 长江大学图书馆电子期刊阅览室CNKI数据库 论文编辑 长江大学图书馆提供的排版所需计算机及其软件 上机时数 不少于100小时
7 工作的主要阶段、进度与时间安排 2013年7月—9月,主要是进行SSR分子标记实验,获得关联群体数据 2013年10月—11月,查阅文献,写开题报告 2013年12月—2014年4月,写论文初稿 2014年5月—6月,修改论文,做答辩 8 指导教师审查意见 签 名: 年 月 日
9 答辩小组意见 组 长 签 字: 成 员 签 字: 年 月 日
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